小儿心胸外科成立于上世纪八十年代， 2019年成为广州市高水平临床重点专科。目前拥有专科固定病床64张，每年收治住院病人约2028人次，年门诊量达16489人次。

小儿心胸外科近五年每年开展各类先天性心脏手术1200余例，常规开展新生儿、低体重、危重复杂先天性心脏病的综合治疗，如双调转术、Senning、Rastelli、Cone、DKS、Ross/Konno、Ross Ⅱ、改良Nikaidoh、Norwood手术、肺血管单元化及先天性气道狭窄行气道成形术等小儿心外科高难度复杂手术。

心脏重症监护室对非手术疾病如暴发性心肌炎及各种原因所导致的心源性休克、多脏器功能衰竭等危重疾病状态的抢救处理，特发性肺动脉高压及新生儿持续肺动脉高压所导致的肺动脉高压危象的抢救及治疗，多脏器功能衰竭的支持及治疗具有丰富经验，常规开展有创及无创呼吸通气、ECMO、CRRT、婴幼儿支气管镜检查。

小儿胸外科常规开展胸壁畸形的矫治（漏斗胸、鸡胸、Poland综合征等）、肺部病变的手术治疗（肺囊性变、肺肿瘤、肺脓肿等）、胸膜腔病变的手术治疗（脓胸、乳糜胸等）、纵隔肿瘤的手术治疗、膈肌病变的手术治疗（膈疝、膈膨升）、食管病变的手术治疗（化学烧伤性食管狭窄、贲门失弛缓征、食管肿瘤等），气管病变的手术治疗。