儿童保健部集医疗、保健、预防、科研、教学一体，履行全市妇幼保健公共卫生职能以及多学科合作的儿童早期发展临床保健相结合的儿童健康服务，是国家级儿童早期发展示范基地、国家级新生儿保健特色专科、广东省儿童早期发展应用工程技术研究中心和广东省科普教育基地。

对全市0-6岁儿童健康开展健康监测及健康管理等多项常规和专项工作。在儿童健康监测和干预中，围产期高危儿全程精细化管理、儿童意外伤害监测、集体儿童营养管理、全市高危儿系统管理评审、新生儿黄疸三级网络协作管理平台、消除艾滋梅毒和乙肝母婴传播工作、家庭科学育儿第一课等项目取得了显著的成绩。其中“保健熊”儿童健康管理智慧化应用获评国家卫生健康委妇幼司全国儿童健康高质量发展优秀案例，入选2023年度国际城市奖全球30个最佳实践案例之一，通过智慧化建设，实践围绕全生命周期三位一体的儿童健康服务模式，推进临床与保健结合，降低因可预防疾病导致的致死致残发生。

儿童保健部基于国家级早期发展示范基地和广东省儿童早期发展应用工程技术研究中心两个重大平台，成为区域儿童早期发展事业推进的主要力量。在立足在该基础上，作为国家临床医学研究中心儿童优发展临床研究联盟单位，儿童保健部积极与粤港澳大湾区、广东省部分区域以及广州市三级妇幼保健网络建立医疗保健战略合作联盟，成立了省儿童早期发展联盟。通过“母婴安康计划”、“高危儿管理”、“智慧健康幼儿园”、“0-3岁托育”、“新生儿黄疸网络监测”等项目，参与广东省、市脑科学计划重大项目，横向与纵向化将医疗保健、科学研究、产品转化齐头并进，促进区域儿童健康成长。

儿童保健部不断扩展国家级儿童早期发展示范基地和国家级新生儿保健重点专科内涵建设，以儿童心理行为发育和高危儿健康管理为核心，设置有儿童学习困难门诊和儿童多动症筛查门诊等特色门诊，还下设多个特色专科，提供产前和产后结合、医疗和预防结合的多学科综合服务，包括：母婴阻断儿童保健门诊、儿童神经保健门诊、儿童语言发育门诊、营养喂养咨询指导门诊、儿童康复门诊、新生儿外科随访门诊等。